乐清籍海归科学家杨焕明领衔完成基因图谱

乐清籍海归科学家杨焕明领衔完成基因图谱

杨焕明被聘为乐清市侨联六届海外顾问

　　前天，由中科院院士、著名乐清籍科学家杨焕明领衔的深圳华大基因研究院发布最新研究进展，公布了第三版的含有最新测序数据的德国大肠杆菌基因组完成图谱，并同时宣告，与其合作研究小组已研制出该大肠杆菌的快速诊断试剂盒，将无偿提供检测实验方法细节及所需引物序列信息，给全球范围内的病情诊断、疫情监测和污染源调查提供支持。

　　德国大肠杆菌疫情爆发之后，华大基因立即与德国汉堡大学医学院、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所建立联系，开展合作，成立专门研究小组对该细菌进行测序和生物信息学分析，以便尽快寻找到致病机理。

　　据华大基因新闻发言人杨碧澄介绍，华大基因是5月24日获得德国病菌样本，仅三天时间，就完成对该新型大肠杆菌第一次基因组测序，并将该菌株的基因序列上传至NCBI（美国国立生物技术信息中心）数据库，首度揭示了德国疫情是由一种新型的兼具侵袭、产毒、肠出血等特征的超毒大肠杆菌引起，该新型菌株携带多种耐抗生素的特异基因，致使其难以治疗。

　　此次华大基因公布的第三版测序数据，是整合了之前发表的Ion Torrent数据和基于Illumina公司Hiseq测序平台新产生的数据，并进行序列拼接，从而得到第一个真正意义上基于从头测序的完整基因图谱。该图谱，比早前发布的版本更加完整（完整度>99%）并且修正了之前可能出现的组装错误。对该版本的基因组序列的分析也同样证实了该大肠杆菌含有来自肠出血性大肠杆菌（EHEC)和肠黏附性大肠杆菌(EAEC)的致病基因。

　　基于之前的研究成果，华大基因与军事医学科学院微生物流行病研究所的科研人员迅速开展了针对该大肠杆菌的诊断试剂盒的研发。并且于7日验证完成了可快速检测该大肠杆菌菌株的PCR诊断方案。杨碧澄介绍，目前，德国的医疗机构大多还是采用生理、生化指标的测试，确诊病患是否感染新型大肠杆菌，一般得花几天时间，很容易贻误病情，而华大基因的快检试剂，主要通过两对特异性引物的扩增，而鉴定出与黏附性及出血性相关的基因。该方法可在收到样品后2-3小时内提供诊断结果，其对疫情监控和致病病菌的检测起着重要作用。（郭显选　郑海华）